Lucius II jatkaa tarinaa siitä, mihin alkuperäinen peli jäi: Lucius nousee esiin ainoana eloonjääneenä tulipalon raunioista, jotka olivat kerran hänen vanhempiensa koti. Hän selviytyy armottomasta teurastuksesta vahingoittumattomana. Hän on rankaissut heikkoja ja rangaissut pahoja. Hän on katsonut heidän sieluihinsa ja löytänyt heidän todelliset minänsä. Luulottomat hoitajat vievät Luciuksen St. Benedict’s Hospitalin psykiatriseen osastoon. Ilmestyskirja ennustaa lapsen syntymää, joka tulee hallitsemaan maailmaa rautaisella sauvalla. Ensimmäinen osa tätä ennustusta on toteutunut. On aika huolehtia lopusta. Kuiskaukset ennustuksesta löytävät tiensä pojan korviin. Lucius päättää toimia uudelleen palauttaakseen voimansa. Mutta hänellä ei ole aavistustakaan uusista vastustajistaan…
Lucius II:ssa pelaaja pääsee kokemaan ainutlaatuisen käänteen, sillä tässä pelissä pelaat pahista ja aiheutat tuhoa paholaisen poikana. 3D Splatter adventure sandbox -peli jatkaa alkuperäisen pelin tarinaa. Pelissä on yli 100 mahdollista uhria. Lucius voi tutkia laajaa viisikerroksista sairaalaa ja pientä Ludlow’n kaupunkia. Pelissä on kunnianosoitus klassisille kauhuelokuville ja eri nimikkeiden viittauksia löytyy pelin joka puolelta.
