Minigolffi-pelissä pelaajan tavoitteena on saada valkoinen pallo reikään, joka on merkitty mustaksi. Tämä tapahtuu ohjaamalla lyöntiä innovatiivisella järjestelmällä, jossa ensimmäisessä neliössä ruudun alareunassa on tähtäin. Pelaaja voi säätää lyöntisuuntaa keltaisen viivan avulla käyttämällä näppäimiä Q ja A. Lyönnin voimakkuutta säädetään puolestaan W- ja S-näppäimillä. Hiiren avulla tähtäimen kulmaa voidaan säätää vasemmalla tai oikealla napilla, ja voimakkuuspalkkia voi myös säätää hiiren painikkeilla. Jos peliä haluaa lopettaa, painamalla ESC-näppäintä pääsee pois pelistä.
Pelissä on mahdollisuus luoda omia ratalistoja, joita voi käyttää komentamalla ”MGOLFFI RATALIS.TA”, jolloin peli käyttää ’RATALIS.TA’ tiedostoa ratalistana. Näitä ratalistoja voi helposti luoda käyttämällä komentoa ’RATAEDIT #
Jos pallo liikkuu liian hitaasti, pelaaja voi muokata MGOLFFI.DAT-tiedostossa olevaa lukua pienemmäksi. Alun perin tämä luku on asetettu arvoon 500, mutta sitä muuttamalla pallon nopeutta voi säätää pelaajan mieltymysten mukaan. Mikäli pallo liikkuu liian nopeasti, luku kannattaa kasvattaa.
Jos peli ilmoittaa virheestä numero 53, se tarkoittaa, että peli yrittää ladata tiedostoa, jota ei ole olemassa. Lisäohjeita pelin käynnistystoiminnoista saa käynnistämällä pelin komennolla ”MGOLFFI ?”, joka avaa lisätietoja. Pelistä poistuminen tapahtuu painamalla ESC-näppäintä, mikä lopettaa pelin ja vie pelaajan takaisin työpöydälle.